Според ЗДДС документирането на доставките, за които е приложен специален режим на облагане на маржа на цената , става с издаването на два данъчни документа - фактури или известия към тях и протокол.

Програмата предлага два варианта на работа:
ВАРИАНТ 1 -през екраните на склада;
ВАРИАНТ 2 -през екрана на счетоводството. Потребителят работи с програмата без да използува раздел "Склад"
ВАРИАНТ 1- През склада
Покупката на стока се въвежда в склада през екран “Приход”, като “Вид документ” =‘01’ и “Вид сделка” =‘22’, т.е. без право на данъчен кредит. Стойността на сделката е сумата, която е платена или ще бъде платена, включително данъкът по ЗДДС (ако е внос извън общността).
Продажбата на стоката се въвежда през екран “Продажби” като “Вид документ” =‘01’ и “Вид сделка” =‘60’. Стойността на сделката е общата сума, която дилърът е получил или ще получи от клиента, включително всички данъци и такси и др. плащания. Програмата изчислява дължимия за доставката данък и при осчетоводяване на склада продажбата автоматично се контира за нуждите на счетоводството.Тези фактури се записват в "Дневник на продажбите", като колони от 9 до 25 са празни.
В края на отчетния период за ДДС се извежда справка за маржа. За целта се избира “Склад” - “Справки”- “Продажби по документи”, задава се периода и се кликва на радиобутона “Справка за маржа по чл.143 от Закона “. На база тази справка потребителят изготвя месечния Протокол за маржа, който съдържа един запис- това е сумарния ред от справката. По желание на потребителя протоколът може да бъде отпечтан от пограмата и да получи пореден номер от общия списък на протоколите на фирмата. За целта кликва "Склад"-"Документи"-"Издаване на протоколи за ВОП" и на екрана се извежда празна бланка, в която потребителят попълва сумарния ред от справката“Справка за маржа по чл.143 от Закона “. Следва въвеждането на Протокола в счетоводството по следния начин:

“Вид документ” = ‘09’
411/4532
“Вид сделка”= ‘13’ и се въвежда дължимия данък.
На втори ред на същия документ :
411/4532
“Вид сделка”= ‘01’ и се въвежда дължимия данък със знак минус, т.е. сторнира се.
Данните от Протокола ще се запишат в "Дневник на продажбите", съответно в колони 10 и 16 само със стойността на ДДС.
ВАРИАНТ 2 През счетоводството:
През екран "Въвеждане" се въвеждат всички фактури за покупка без право на данъчен кредит (“Вид документ” =‘01’ и “Вид сделка” =‘22’).Фактурите за продажба се въвеждат с “Вид документ” =‘01’ и “Вид сделка” =‘60’ и предварително изчислена от потребителя стойност на маржа и ДДС:
411/702 - стойност на продажбата минус ДДС(изчислено в/у маржа)
Така въведените фактури за продажба ще се запишат в "Дневник на продажбите", като колоните от 9 до 25 са празни.
Потребителят съставя Протокол, който въвежда също през екран "Въвеждане:
"Вид документ"='09'
411/4532
“Вид сделка”= ‘13’ и се въвежда дължимия данък.
Данните от Протокола ще се запишат в "Дневник на продажбите", съответно в колони 10 и 16 само със стойността на ДДС.